复旦大学附属肿瘤医院骨软组织外科（Department of Musculoskeletal Oncology）成立于2016年11月，主要治疗骨肿瘤、软组织肿瘤及恶性黑色素瘤，是中国最早的黑色素瘤手术中心。科室为中国抗癌协会肉瘤专委会副主委单位、中国抗癌协会黑色素瘤专委会副主委单位、中国医药教育协会肢体肿瘤分会主委单位、上海市抗癌协会肉瘤专委会主委单位以及上海市抗癌协会黑色素瘤专委会主委单位，同时也是复旦大学恶性黑色素瘤诊治中心和脊柱肿瘤诊治中心。科室分别建立了以骨肿瘤、软组织肿瘤和恶性黑色素瘤为方向的人才队伍，构建了不同年龄段的老中青人才梯队，以实现良性的人才培养循环。
复旦肿瘤厦门医院骨软组织外科于2025年1月3日成立，同日，复旦大学附属肿瘤医院骨软组织肉瘤MDT首席专家严望军教授来到厦门医院，操刀完成厦门首台骨软组织肉瘤切除手术，成功填补了厦门在骨软组织肉瘤保肢治疗的空白。作为厦门首个骨软组织外科，科室特邀上海总院骨软组织外科主任严望军教授担任学科带头人，恶性黑色素瘤诊治中心主任陈勇教授担任黑色素瘤专病首席专家，孙正望教授任科室执行主任。科室常驻医师均经过上海总院进修、培训并通过考核，具有丰富的临床诊疗经验。