复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科成立于2000年，在20年不断开拓和进取下，已成为我国最主要的乳腺癌基础和临床研究团队之一，在国内外享有盛誉。目前，科室拥有五大病区共270余张正式床位，诊断部、综合治疗部、临床试验部、乳腺癌研究所等多个分支部门。梯队建设结构合理，后备人才充足，现拥有多名国际、国内知名乳腺癌诊疗专家。以乳腺外科为依托主体的乳腺肿瘤学科获得卫生部临床重点学科、教育部“肿瘤学”国家重点学科、“211工程”和“985工程”的支持，并获评上海市乳腺癌临床医学中心，拥有上海市乳腺肿瘤重点实验室，获评上海市劳模创新工作室，复旦大学十佳医疗团队等等。
作为上海总院“同质化建设”的重点科室，复旦肿瘤厦门医院乳腺外科依托上海总院乳腺外科（国家级临床重点专科）的核心资源，实现科室管理、临床技术、诊疗规范、人才建设“四统一”。2024年7月成立邵志敏名医工作室，秉承“精诚、仁爱、创新、卓越”理念。邵志敏教授、吴炅教授、柳光宇教授、李俊杰教授等全国顶尖专家定期来厦坐诊、手术和指导工作，科室执行主任李剑伟教授常驻厦门主持工作。率先引入上海总院乳腺疑难病例多学科讨论（MDT）模式，联合上海总院及厦门医院的肿瘤内科、放疗科、病理科、放射诊断科等科室建立“一站式乳腺疾病诊疗中心”，大幅减少厦门及周边市民奔波上海就诊的带来的繁琐就诊流程和排队时间，使患者在本地即可享受与总院同等高质量的医疗资源，更高效、更快速、更便捷的接受标准化、精准化乳腺疾病诊疗。
科室现有开放床位24张，年门诊量1000余人次，年收治住院患者800余人次，依托上海总院技术同质化迁移，已实现两项全省首例技术突破：全省首例俯卧位断层钼靶置针定位活检和全省首例俯卧位断层钼靶微创旋切手术。依托福建省首台俯卧位断层钼靶机，创新技术引导精准诊疗，显著提升早期乳腺癌检出率与微创手术安全性。科室常规进行乳管镜检查、乳房肿块穿刺活检术、乳腺良性肿瘤微创旋切术等诊断技术，常规开展乳腺良、恶性肿瘤的手术治疗，包括乳腺癌保乳手术、乳腺癌改良根治术、前哨淋巴结活检术、乳房重建手术（自体组织重建手术如DIEP等、假体重建术、扩张器置入术）、腔镜辅助下乳腺手术等，使患者在得到乳腺癌治疗的同时，大幅提高生活质量。常规开展乳腺恶性肿瘤的综合治疗，治疗方案均由上海总院乳腺综合治疗部讨论制定，为闽西南地区患者提供便捷、前沿、国际一流的乳腺肿瘤个体化精准诊疗服务。